借1000元三个月还清，利息该如何计算？

借款利息计算：利息=本金×天数×利率。自然人之间对借款利息有约定的，从约定；没有约定的或者约定不明确的，视为没有利息。自然人之间借贷的，双方约定的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍。《民法典》第六百八十条
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这个问题要看什么时候借的钱，双方是否约定支付利息。如果没有约定就不用支付利息。民间借贷，一般参照银行同期贷款利率来确定。
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利息计算有以下几种方法：1、积数计息法：贷款利息=计息积数×日利率，其中计息积数=每日余额合计数。2、逐笔计息法：按照基本的计息公式利息=本金×利率×贷款期限进行逐笔计算，一般有以下三种：(1)计息期为整年(月)：利息=本金×年(月)数×年(月)利率。(2)计息期有整年(月)又有零头天数：利息=本金×年(月)数×年(月)利率+本金×零头天数×日利率。(3)计息期全部化为实际天数：利息=本金×实际天数×日利率(每年为365天(闰年366天)，每月为当月公历实际天数)。