恶意诽谤我的商店。某某也来检查。某某也证明

您若想起诉发布恶意诽谤视频的人，根据《刑法》第二百四十六条关于诽谤罪的规定，需准备相关证据材料，包括视频截图、发布者信息、视频内容证明其虚假性及对您商店造成的损害等。同时，若其行为构成商业诋毁，依据《刑法》第二百二十一条关于损害商业信誉、商品声誉罪的规定，您还需提供证明其恶意投诉、损害您商誉及造成重大损失的证据。准备好这些材料后，可向人民法院提起诉讼。
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若发布视频的人已删除视频并道歉，您是否起诉需视情况而定：1.若其诽谤行为未给您造成严重后果或重大损失，且其已公开道歉并消除影响，您可考虑不起诉；2.若其诽谤行为已造成严重后果，如市场监督局介入检查、您商店声誉受损等，即使其已道歉，您仍有权依据相关法律条款起诉，维护自身权益。
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从法律角度，您可采取以下措施应对恶意诽谤行为：1.收集并保存证据，如视频截图、发布者信息等；2.向平台举报，要求删除侵权内容；3.公开澄清事实，消除不良影响；4.若情节严重，可考虑向公安机关报案或向人民法院提起民事诉讼，要求侵权人承担法律责任，赔偿损失。